Nové trendy vo využívaní bioinformatických analýz v genomike a proteomike pre študentov vetrinárnych a biomedicínskych odborov

Basic informations

Thematic area: komisia č. 2 pre nové technológie, metódy a formy vo vzdelávaní

Project name (Slovak): Nové trendy vo využívaní bioinformatických analýz v genomike a proteomike pre študentov vetrinárnych a biomedicínskych odborov

Project name (English): New trends in aplication of bioinformatical analyses in genomics and proteomics designated for students of veterinary and biomedical disciplines

Start of project: 2011

End of project: 2013

Condition of project: Ukončený

Project number: 005UVLF-4/2011

Project leader: MVDr. Mangesh Bhide, PhD.

University: Univerzita veterinárskeho lekárstva a farmácie v Košiciach

Anotácia originálnych výsledkov riešenia projektu v slovenskom jazyku

Hlavným prínosom projektu bola sumarizácia a prezentácia využívaných bioinformatických nástrojov na poli genomiky a proteomiky do prehľadnej monografie, ktorá  už v súčasnosti slúži ako študijná literatúra. Nami organizovaný workshop a vytvorená internetová stránka (obsahujúca protokoly, softvéry, odkazy na databázy, diskusné fórum) je veľkou podporou  pre vedeckú prax pri riešení ich vedeckých projektov.

 

Description of original results of the project in English

The main benefit of the project was to summarize the currently used bioinformatic tools  for genomics and proteomics into a comprehensive monograph, which is now used as a primery study literature by students and scientific workers. Moreover, the web page containing protocols, list of softwares and databases and discussion forum, is becoming significant support for researchers around us.

Financial grant of MŠVVandŠ SR within KEGA

	Financial grant of MŠVVandŠ SR within KEGA	Capital expenditures in €
Drawn in year 2011	7 145,00	0,00
Drawn in year 2012	10 387,00	0,00
Drawn in year 2013	9 468,00	0,00
Pumped for the entire period of the project	27 000,00	0,00

List of project outcomes for the entire solution

Publishing activity

Category code	Specific output, name (ISBN, number of pages a i.)
AAB	Nové trendy vo využívaní bioinformatických analýz v genomike a proteomike; Monografia o bioinformatických nástrojoch používaných v genomike a proteomike; ISBN 978-80-8077-321-2, 172 s.

Other outcomes (eg e-learning, websites, virtual laboratory, training, courses, workshops and the like.)

Output name	Description of output	Link
Workshop "Nové trendy vo využívaní bioinformatických analýz v genomike a proteomike"	Workshop sa uskutočnil 3.5. 2013 na UVLF v Košiciach, ktorý bol rozdelený do sekcií: 1. PCR reakcia- jej dizajn a analýza (S. Dolinská, 2. Genotypizácia a bioinformatika (M. Bhide), 3. Sekvenovanie ďalšej generácie- analýza a spracovanie získaných dát (L. Pulzová), 4. Bioinformatická analýza sekvencií génov a proteínov (P. Mlynárčik), 5. Hmotnostná spektrometria a bioinformatická identifikácia biomolekúl (E. Bencúrová). Workshop spojený s "hands-on" tréningom umožnil účastníkom prakticky sa oboznámiť s prácou s databázami a softvérmi.	http://lbmi.uvm.sk
Webová stránka	Webová stránka obsahujúca odkazy na on-line databázy a softvéry, zoznam softvérov zakúpených z finančných prostriedkov tohto projektu a zoznam nami používaných protokolov a pracovných postupov. Na stránke je umiestnená aj monografia v elektronickej forme a diskusné fórum, ktoré je určené pre technickú podporu v rámci bioinformatiky.	https://dl.dropboxusercontent.com/u/136133154/LBMI/The_Laboratory.html

Final evaluation of the commission KEGA

Splnil ciele excelentne (s dosiahnutím celospoločenských prínosov).